纽约州警察 DNA 数据库实验室与纽约州刑事司法服务部 (DCJS) 合作,负责处理已定罪罪犯和受检者的 DNA 样本,以纳入州联合 DNA 索引系统 (CODIS)。DNA 数据库负责管理州 CODIS,这是一个分层的 FBI 程序,用于支持刑事司法 DNA 数据库。CODIS 包含三个层级:国家 DNA 索引系统 (NDIS)、州 DNA 索引系统 (SDIS) 和本地 DNA 索引系统 (LDIS)。纽约州 DNA 索引系统 (NY-SDIS) 按照纽约州行政法第 995 条第 49-B 条运行,包含纽约州 DNA 数据库和纽约州内八个本地法医检测实验室中的罪犯的 DNA 图谱。